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3 次元ボリューム イメージの処理

3 次元体積データに対するフィルター処理、セグメント化およびその他の画像処理演算の実行

3 次元データセットで、ピクセル演算、局所フィルター処理、モルフォロジー、およびその他の画像処理を実行します。

アプリ

ボリューム ビューアーボリューム データとラベル付きボリューム データの表示

関数

すべて展開する

volshowボリュームの表示
labelvolshowラベル付きボリュームの表示
sliceViewerイメージ スライスの参照
orthosliceViewerグレースケール ボリュームまたは RGB ボリュームの直交スライスの参照
adaptthresh局所的な 1 次統計量を使用する適応的なイメージのしきい値
imbinarizeしきい値処理による 2 次元グレースケール イメージまたは 3 次元ボリュームの 2 値化
dicomreadDICOM イメージの読み取り
dicomreadVolumeDICOM イメージのセットからの 4 次元ボリュームの構築
dicomContoursDICOM-RT 構造体セットからの ROI データの抽出
niftiinfoNIfTI ファイルからメタデータの読み取り
niftiwriteNIfTI フォーマットを使用したファイルへのボリュームの書き込み
niftireadNIfTI イメージの読み取り
imabsdiff2 つのイメージの差の絶対値
imadd2 つのイメージを追加または定数をイメージに追加
imdivideあるイメージを別のイメージに除算、またはイメージを定数で除算
immultiply2 つのイメージの乗算、またはイメージと定数の乗算
imsubtractイメージを他のイメージから減算する、またはイメージから定数を減算する
affine3d 3 次元アフィン幾何学的変換
imcrop33 次元イメージのトリミング
imref3dワールド座標に対する 3 次元イメージの参照
imregister強度ベースのイメージ レジストレーション
imregdemons2 つの 2 次元イメージまたは 3 次元イメージを位置合わせさせる変位場の推定
imresize33 次元ボリューム強度イメージのサイズ変更
imrotate33 次元ボリューム グレースケール イメージの回転
imwarpイメージへの幾何学的変換の適用
obliqueslice3 次元ボリューム データからの斜体スライスの抽出
fibermetricイメージ内の細長い構造またはチューブ状構造の強調
fspecial3事前定義型の 3 次元フィルターの作成
histeqヒストグラム均等化を使用したコントラストの強調
imadjustnN 次元ボリューム イメージの強度値の調整
imboxfilt33 次元イメージの 3 次元ボックス フィルター処理
imfilter多次元イメージの N 次元フィルター処理
imgaussfilt33 次元イメージの 3 次元ガウス フィルター処理
imhistmatchn参照イメージのヒストグラムと一致させるために N 次元イメージのヒストグラムを調整
imnoiseイメージにノイズを付加
integralBoxFilter33 次元積分イメージの 3 次元ボックス フィルター処理
integralImage33 次元インテグラル イメージの計算
medfilt33 次元のメディアン フィルター処理
bwareaopenバイナリ イメージからの小さなオブジェクトの削除
bwconncompバイナリ イメージ内の連結要素を検出
bwmorph3バイナリ ボリュームのモルフォロジー演算
bwskelすべてのオブジェクトを 2 次元のバイナリ イメージまたは 3 次元のバイナリ ボリュームの線に縮小
imbothatボトム ハット フィルター処理
imcloseイメージにモルフォロジー クロージングを行う
imdilateイメージの膨張
imerodeイメージの収縮
imopenイメージのモルフォロジー オープニング
imreconstructモルフォロジー再構成
imregionalmax局所的な最大値
imregionalmin局所的な最小値
imtophatトップ ハット フィルター処理
offsetstrelモルフォロジー オフセット構造化要素
strelモルフォロジー構造化要素
watershedWatershed 変換
activecontour動的輪郭 (snakes) 領域拡張法を使用した前景と背景へのイメージのセグメント化
bfscoreイメージのセグメンテーションのための輪郭マッチング スコア
diceイメージ セグメンテーションのための Sørensen-Dice 類似度係数
gradientweightイメージの勾配に基づいてイメージ ピクセルの重みを計算
graydiffweightグレースケール強度の差に基づくイメージ ピクセルの重み計算
imsegfmm高速マーチング法を使用したバイナリ イメージのセグメンテーション
imsegkmeans3k-means クラスタリング ベースのボリューム セグメンテーション
jaccardイメージ セグメンテーションのための Jaccard 類似度係数
superpixels33 次元イメージの 3 次元スーパーピクセル オーバーセグメンテーション
bwselect3バイナリ ボリュームのオブジェクトを選択
edge33 次元強度ボリューム内のエッジの検出
imgradient33 次元イメージの勾配の大きさと方向の検出
imgradientxyz3 次元イメージの方向勾配の検出
imhistイメージ データのヒストグラム
regionprops33 次元ボリューム イメージ領域のプロパティの計測
randomPatchExtractionDatastoreイメージまたはピクセル ラベル イメージから 2 次元または 3 次元のランダム パッチを抽出するためのデータストア
centerCropWindow3d直方体の中央トリミング ウィンドウの作成
randomCropWindow3dランダムな直方体のトリミング ウィンドウの作成
randomAffine3dランダムな 3 次元アフィン変換の作成
affineOutputViewワーピング イメージの出力表示の作成

トピック

入力ボリューム強度イメージの 3 次元スーパーピクセルの計算

この例では、3 次元 MRI データをスーパーピクセルのグレースケール強度イメージに変換する方法を説明します。

ボリューム ビューアー アプリを使用した 3 次元ボリューム データの調査

ボリューム ビューアー アプリを使用して、3 次元ボリューム データの直交断面を表示できます。レンダリングを調整してボリュームの構造を明らかにします。

ボリューム ビューアー アプリを使用した 3 次元ラベル付きボリューム データの調査

ボリューム ビューアー アプリを使用して、3 次元ラベル付きボリューム データを表示できます。ボリュームとラベル付きボリュームを同時に表示して、不透明度とカラーマップを変更できます。

ボリュームの深層学習向け前処理 (Deep Learning Toolbox)

ボリューム イメージとラベル データを読み取り、3 次元深層学習向けに前処理します。

注目の例