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3 次元ボリューム イメージの処理

3 次元体積データに対するフィルター処理、セグメント化およびその他の画像処理演算の実行

3 次元データセットで、ピクセル演算、局所フィルター処理、モルフォロジー、およびその他の画像処理を実行します。

アプリ

ボリューム ビューアーボリューム データとラベル付きボリューム データの表示

関数

すべて展開する

volshowボリュームの表示
labelvolshowラベル付きボリュームの表示
sliceViewerイメージ スライスの参照
orthosliceViewerグレースケール ボリュームまたは RGB ボリュームの直交スライスの参照
adaptthresh局所的な 1 次統計量を使用する適応的なイメージのしきい値
imbinarizeしきい値処理による 2 次元グレースケール イメージまたは 3 次元ボリュームの 2 値化
dicomreadDICOM イメージの読み取り
dicomreadVolumeDICOM イメージのセットからの 4 次元ボリュームの構築
niftiinfoNIfTI ファイルからメタデータの読み取り
niftiwriteNIfTI フォーマットを使用したファイルへのボリュームの書き込み
niftireadNIfTI イメージの読み取り
imabsdiff2 つのイメージの差の絶対値
imadd2 つのイメージを追加または定数をイメージに追加
imdivideあるイメージを別のイメージに除算、またはイメージを定数で除算
immultiply2 つのイメージの乗算、またはイメージと定数の乗算
imsubtractイメージを他のイメージから減算する、またはイメージから定数を減算する
affine3d 3 次元アフィン幾何学的変換
imcrop33 次元イメージのトリミング
imref3dワールド座標に対する 3 次元イメージの参照
imregister強度ベースのイメージ レジストレーション
imregdemons2 つの 2 次元イメージまたは 3 次元イメージを位置合わせさせる変位場の推定
imresize33 次元ボリューム強度イメージのサイズ変更
imrotate33 次元ボリューム グレースケール イメージの回転
imwarpイメージへの幾何学的変換の適用
fibermetricイメージ内の細長い構造またはチューブ状構造の強調
fspecial3事前定義型の 3 次元フィルターの作成
histeqヒストグラム均等化を使用したコントラストの強調
imadjustnN 次元ボリューム イメージの強度値の調整
imboxfilt33 次元イメージの 3 次元ボックス フィルター処理
imfilter多次元イメージの N 次元フィルター処理
imgaussfilt33 次元イメージの 3 次元ガウス フィルター処理
imhistmatchn参照イメージのヒストグラムと一致させるために N 次元イメージのヒストグラムを調整
imnoiseイメージにノイズを付加
integralBoxFilter33 次元積分イメージの 3 次元ボックス フィルター処理
integralImage33 次元インテグラル イメージの計算
medfilt33 次元のメディアン フィルター処理
bwareaopenバイナリ イメージからの小さなオブジェクトの削除
bwconncompバイナリ イメージ内の連結要素を検出
bwmorph3バイナリ ボリュームのモルフォロジー演算
bwskelすべてのオブジェクトを 2 次元のバイナリ イメージまたは 3 次元のバイナリ ボリュームの線に縮小
imbothatボトム ハット フィルター処理
imcloseイメージにモルフォロジー クロージングを行う
imdilateイメージの膨張
imerodeイメージの収縮
imopenイメージのモルフォロジー オープニング
imreconstructモルフォロジー再構成
imregionalmax局所的な最大値
imregionalmin局所的な最小値
imtophatトップ ハット フィルター処理
offsetstrelモルフォロジー オフセット構造化要素
strelモルフォロジー構造化要素
watershedWatershed 変換
activecontour 動的輪郭 (snakes) を使用した前景と背景へのイメージのセグメント化
bfscoreイメージのセグメンテーションのための輪郭マッチング スコア
diceイメージ セグメンテーションのための Sørensen-Dice 類似度係数
gradientweightイメージの勾配に基づいてイメージ ピクセルの重みを計算
graydiffweightグレースケール強度の差に基づくイメージ ピクセルの重み計算
imsegfmm高速マーチング法を使用したバイナリ イメージのセグメンテーション
imsegkmeans3k-means クラスタリング ベースのボリューム セグメンテーション
jaccardイメージ セグメンテーションのための Jaccard 類似度係数
superpixels33 次元イメージの 3 次元スーパーピクセル オーバーセグメンテーション
bwselect3バイナリ イメージのオブジェクトを選択
edge33 次元強度ボリューム内のエッジの検出
imgradient33 次元イメージの勾配の大きさと方向の検出
imgradientxyz3 次元イメージの方向勾配の検出
imhistイメージ データのヒストグラム
regionprops33 次元ボリューム イメージ領域のプロパティの計測
randomPatchExtractionDatastoreイメージまたはピクセル ラベル イメージから 2 次元または 3 次元のランダム パッチを抽出するためのデータストア
centerCropWindow3d直方体の中央トリミング ウィンドウの作成
randomCropWindow3dランダムな直方体のトリミング ウィンドウの作成
randomAffine3dランダムな 3 次元アフィン変換の作成
affineOutputViewワーピング イメージの出力表示の作成

トピック

入力ボリューム強度イメージの 3 次元スーパーピクセルの計算

この例では、3 次元 MRI データをスーパーピクセルのグレースケール強度イメージに変換する方法を説明します。

ボリューム ビューアー アプリを使用した 3 次元ボリューム データの調査

ボリューム ビューアー アプリを使用して、3 次元ボリューム データの直交断面を表示できます。レンダリングを調整してボリュームの構造を明らかにします。

ボリューム ビューアー アプリを使用した 3 次元ラベル付きボリューム データの調査

ボリューム ビューアー アプリを使用して、3 次元ラベル付きボリューム データを表示できます。ボリュームとラベル付きボリュームを同時に表示して、不透明度とカラーマップを変更できます。

ボリュームの深層学習向け前処理 (Deep Learning Toolbox)

ボリューム イメージとラベル データを読み取り、3 次元深層学習向けに前処理します。

注目の例