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plotResiduals

一般化線形回帰モデルの残差プロット

説明

plotResiduals(mdl) は、一般化線形回帰モデル (mdl) の残差のヒストグラム プロットを作成します。

plotResiduals(mdl,plottype) は、残差のプロット タイプ plottype を指定します。

plotResiduals(mdl,plottype,Name,Value) では、1 つ以上の名前と値のペアの引数を使用して追加オプションを指定します。たとえば、残差のタイプや、残差のデータ点のグラフィック プロパティを指定できます。

h = plotResiduals(___) は、前の構文におけるいずれかの入力引数の組み合わせを使用して、プロット内のラインまたはパッチのグラフィックス オブジェクトを返します。プロットの作成後に特定のラインまたはパッチのプロパティを修正するには、h を使用します。プロパティの一覧については、Line のプロパティ および Patch のプロパティ を参照してください。

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あてはめた一般化線形回帰モデルのプロットを 3 つ (生の残差のヒストグラム、生の残差の正規確率プロット、および Anscombe タイプの残差の正規確率プロット) 作成します。

元となる 2 つの予測子 X(:,1) および X(:,2) のポアソン乱数を使って標本データを生成します。

rng('default') % For reproducibility
rndvars = randn(100,2);
X = [2 + rndvars(:,1),rndvars(:,2)];
mu = exp(1 + X*[1;2]);
y = poissrnd(mu);

ポアソン データの一般化線形回帰モデルを作成します。

mdl = fitglm(X,y,'y ~ x1 + x2','Distribution','poisson');

確率密度関数のスケールを使用して、生の残差のヒストグラムを作成します。

plotResiduals(mdl)

各バーの面積は、観測値の相対的な個数です。バーの面積の合計は 1 に等しくなります。

生の残差の正規確率プロットを作成します。

plotResiduals(mdl,'probability')

裾における残差は、より分散しているので、正規分布に一致しません。

Anscombe タイプの残差の正規確率プロットを作成します。

plotResiduals(mdl,'probability','ResidualType','Anscombe')

Anscombe タイプの残差は正規分布に一致します。

入力引数

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一般化線形回帰モデル。fitglm または stepwiseglm を使用して作成した GeneralizedLinearModel オブジェクトとして指定します。

プロット タイプ。次の表のいずれかの値として指定します。

説明
'caseorder'残差とケース順 (行番号) の比較
'fitted'残差と近似値の比較
'histogram'確率密度関数のスケールを使用した、残差のヒストグラム。各バーの面積は、観測値の相対的な個数です。バーの面積の合計は 1 に等しくなります。
'lagged'残差とラグ付き残差の比較 (r(t) と r(t – 1))
'probability'残差の正規確率プロット。詳細については、probplotを参照してください。
'symmetry'メディアン周辺の残差の対称性プロット (上裾の残差から中央値を減算した値と中央値から下裾の残差を減算した値の比較)。このプロットには、残差の対称性を確認するための、y = x に対応する点線の基準線が含まれています。

名前と値のペアの引数

オプションの Name,Value 引数のコンマ区切りペアを指定します。Name は引数名で、Value は対応する値です。Name は引用符で囲まなければなりません。Name1,Value1,...,NameN,ValueN のように、複数の名前と値のペアの引数を、任意の順番で指定できます。

例: 'Color','blue','Marker','o'

メモ

ここでは、グラフィック プロパティの一部だけを紹介しています。完全な一覧は、ラインについては Line のプロパティ、ヒストグラムについては Patch のプロパティ を参照してください。指定したプロパティは、残差のデータ点の外観またはヒストグラムの外観に適用されます。

プロットで使用する残差のタイプ。'ResidualType' と次の表のいずれかの値から構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。

説明
'Raw'観測した値から近似した値を減算した値
'LinearPredictor'調整応答値から予測子の近似線形結合を減算した値に等しい、線形予測子のスケールでの残差
'Pearson'生の残差を応答の推定標準偏差で除算した値
'Anscombe'歪度を削除するために選択した変換で変換データに対して定義された残差
'Deviance'観測の逸脱度への寄与に基づく残差。

mdlResiduals プロパティには、plotResiduals がプロットの作成に使用した残差の値が格納されます。

例: 'ResidualType','Pearson'

ラインの色。'Color' と RGB 3 成分、16 進数のカラー コード、または、以下の表に記載されているいずれかの色オプションに対応する色の名前または省略名から構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。

'MarkerEdgeColor''auto' (既定) であり 'MarkerFaceColor''auto' である場合、名前と値のペアの引数 'Color' はマーカーの輪郭の色とマーカーの塗りつぶし色も決定します。

カスタム色の場合は、RGB 3 成分または 16 進数のカラー コードを指定します。

  • RGB 3 成分は、色の赤、緑、青成分の強度を指定する 3 要素の行ベクトルです。強度は範囲 [0,1] に含まれていなければなりません。たとえば [0.4 0.6 0.7] のようになります。

  • 16 進数のカラー コードは、ハッシュ記号 (#) で始まり、0 から F の範囲にある 16 進数が 3 つまたは 6 つ続く、文字ベクトルまたは string スカラーです。この値では、大文字と小文字は区別されません。したがって、カラー コード '#FF8800''#ff8800''#F80''#f80' は等価です。

あるいは、一部の一般的な色を名前で指定できます。次の表は、名前が付いた色のオプション、等価な RGB 3 成分、および 16 進数のカラー コードの一覧です。

色の名前省略名RGB 3 成分16 進数のカラー コード外観
'red''r'[1 0 0]'#FF0000'

'green''g'[0 1 0]'#00FF00'

'blue''b'[0 0 1]'#0000FF'

'cyan' 'c'[0 1 1]'#00FFFF'

'magenta''m'[1 0 1]'#FF00FF'

'yellow''y'[1 1 0]'#FFFF00'

'black''k'[0 0 0]'#000000'

'white''w'[1 1 1]'#FFFFFF'

'none'該当なし該当なし該当なし色なし

以下は、MATLAB® が多くのタイプのプロットで使用する既定の色に対する RGB 3 成分および 16 進数のカラー コードです。

RGB 3 成分16 進数のカラー コード外観
[0 0.4470 0.7410]'#0072BD'

[0.8500 0.3250 0.0980]'#D95319'

[0.9290 0.6940 0.1250]'#EDB120'

[0.4940 0.1840 0.5560]'#7E2F8E'

[0.4660 0.6740 0.1880]'#77AC30'

[0.3010 0.7450 0.9330]'#4DBEEE'

[0.6350 0.0780 0.1840]'#A2142F'

例: 'Color','blue'

ラインの幅。'LineWidth' と正の値 (ポイント単位) から構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。ラインにマーカーがある場合、ライン幅はマーカー エッジにも影響を与えます。

例: 'LineWidth',0.75

マーカー記号。'Marker' と次の表のいずれかの値から構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。

説明
'o'
'+'プラス記号
'*'アスタリスク
'.'
'x'十字
'square' または 's'正方形
'diamond' または 'd'菱形
'^'上向き三角形
'v'下向き三角形
'>'右向き三角形
'<'左向き三角形
'pentagram' または 'p'星形五角形
'hexagram' または 'h'星形六角形
'none'マーカーなし

例: 'Marker','+'

マーカーの輪郭の色。'MarkerEdgeColor' と RGB 3 成分、16 進数のカラー コード、または、名前と値のペアの引数 Color に記載されているいずれかの色オプションに対応する色の名前または省略名から構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。

既定値 'auto' では、'Color' を使用して指定されるものと同じ色が使用されます。

例: 'MarkerEdgeColor','blue'

マーカーの塗りつぶし色。'MarkerFaceColor' と RGB 3 成分、16 進数のカラー コード、または、名前と値のペアの引数 Color に記載されているいずれかの色オプションに対応する色の名前または省略名から構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。

'auto' では、'Color' を使用して指定されるものと同じ色が使用されます。

例: 'MarkerFaceColor','blue'

マーカー サイズ。'MarkerSize' と正の値 (ポイント単位) から構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。

例: 'MarkerSize',2

出力引数

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プロット内のラインまたはパッチに対応するグラフィックス オブジェクト。グラフィックス配列として返されます。グラフィックス オブジェクトのプロパティのクエリと設定を行うには、ドット表記を使用します。詳細については、Line のプロパティ および Patch のプロパティ を参照してください。

名前と値のペアの引数を使用して、1 番目のグラフィックス オブジェクト h(1) に対応する、残差のデータ点の外観またはヒストグラムの外観を指定できます。

詳細

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逸脱度

"逸脱度" はモデルの対数尤度の 2 倍です。この全体の対数尤度は各観測の対数尤度の総和であるため、逸脱度タイプの残差プロットは観測ごとの対数尤度を表示します。

ヒント

  • データ カーソルを使用すると、選択したプロットの点の値がデータ ヒント (データ点の横にある小さいテキスト ボックス) に表示されます。データ ヒントには、選択した点の x 軸および y 軸の値と、観測値の名前または番号が含まれます。

代替機能

GeneralizedLinearModel オブジェクトには、複数のプロット関数が用意されています。

  • モデルを検証するときに、問題があるデータを探し、各観測値の効果を理解するには、plotDiagnostics を使用します。また、モデルの残差を分析するには、plotResiduals を使用します。

  • モデルをあてはめた後で、特定の予測子の効果を理解するには、plotPartialDependence を使用します。また、予測曲面を通るスライスをプロットするには、plotSlice を使用します。

R2012a で導入