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createMask

dicomContours オブジェクトからのボリューム マスクの作成

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構文

BW = createMask(rtContours,ROIindex,Spatial)

説明

例

BW = createMask(rtContours,ROIindex,Spatial) は、3 次元 logical マスク BW を返します。これは、dicomContours オブジェクト rtContours における、ROIindex で指定された ROI のボクセル表現です。ROIindex は、密化する rtContours の輪郭を指定します。Spatial は、3 次元データの位置、解像度、および方向を指定します。

例

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ライブ スクリプトを開く

dicomInfo および imref3d を使用して、dicomContours オブジェクトのマスクを作成します。

DICOM-RT 構造体セットのメタデータを読み取ります。

info = dicominfo('rtstruct.dcm');

dicomContours オブジェクトを構築します。

rtContours = dicomContours(info);

すべての ROI 情報を table として表示します。

rtContours.ROIs
ans=2×5 table
    Number          Name           ContourData    GeometricType       Color    
    ______    _________________    ___________    _____________    ____________

      1       {'Body_Contour' }    {90×1 cell}     {90×1 cell}     {3×1 double}
      2       {'Tumor_Contour'}    {21×1 cell}     {21×1 cell}     {3×1 double}

plotContours を使用して、すべての ROI の輪郭をプロットします。このオブジェクト関数はワールド座標の輪郭をプロットします。このプロットを使用して、内部に密化マスクを作成する imref3d オブジェクトのワールド座標の限界範囲を定義します。

plotContour(rtContours)

イメージが輪郭と同じスペースに収まるよう、plotContours からのプロットと同じワールド座標範囲で imref3d オブジェクトを作成します。

referenceInfo = imref3d([128,128,50],xlim,ylim,zlim);

rtContours の 1 番目の輪郭 ('Body_Contour') の 3 次元 logical マスクを作成します。imref3d オブジェクトを指定します。 

contourIndex = 1;  
rtMask = createMask(rtContours, contourIndex, referenceInfo);

ボリューム ビューアーを使用して、このマスクを表示します。

volshow(rtMask);

入力引数

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DICOM 輪郭。dicomContours オブジェクトとして指定します。

データ型: dicomContours

DICOM 輪郭オブジェクト内の ROI。dicomContours オブジェクトに含まれる ROI table 内の数値または名前として指定します。

ROI 識別子型例
NumberrtContours オブジェクトに含まれる ROI table 内の行を識別する整数。Number は ROI table の 1 列目です。rtMask = createMask(rtContours,1, spatialInfo)
Name rtContours オブジェクトに含まれる ROI table 内の ROI を識別する名前。char 配列または string スカラーとして指定します。Name は ROI table の 2 列目です。rtMask = createMask(rtContours,'Body_Contour',spatialInfo)

データ型: single | double | int8 | int16 | int32 | int64 | uint8 | uint16 | uint32 | uint64 | char | string

空間参照情報。dicomreadVolume によって返される Spatial 構造体または imref3d オブジェクトとして指定します。空間参照情報は、3 次元座標データの位置、解像度、および方向を提供します。

データ型: struct | imref3d

出力引数

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logical マスク。3 次元 logical 配列として返されます。

バージョン履歴

R2020b で導入

参考

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