SimBiology

血漿のモデルを中央の [Diagram] ウィンドウに表示する SimBiology Model Builder。左側が [Browser] パネル、右側が [Property Editor]。

QSP、PBPK、および PK/PD モデルの構築

SimBiology Model Builder で、紙に描くようにモデルを構築したり、既存の SBML モデルをインポートしたりできます。dose オブジェクトおよび variant オブジェクトを使用して、投与戦略 (10:00)を適用し、代替数量値を格納します。

腫瘍重量の経時的なプロットを表示する SimBiology Model Analyzer。左側は、プロジェクトの詳細を表示する [Browser] パネル、右側は、選択された応答を表示する [Property Editor]。

モデルの動作のシミュレーション

SimBiology Model Analyzer またはプログラムツールを使用して、さまざまな決定論的ソルバーや確率的ソルバーをシミュレーションします。自動単位変換は、すべての数量を一貫した単位系に変換します。解析からレポートを生成します。

4 つの異なるパラメーター推定値の 95% 信頼区間を表示する 4×1 プロット。

パラメーター推定のためのデータの当てはめ

非線形回帰局所的、大域的、またはハイブリッドの手法とともに使用して、パラメーターを推定します。パラメーターと予測信頼区間を計算します。NLME モデリングを使用して、固定効果と変量効果の両方を考慮します。

モンテ カルロ シミュレーションの実行

パラメータースキャンとモンテ カルロ シミュレーションを実行し、さまざまな条件や投与計画におけるモデルの動作を評価します。対話形式のスライダーを使用して、量的変動がモデルの応答に与える影響を調べます。

グローバルおよびローカル感度解析

感度解析を行うことで、モデルの量的変動がモデル応答に及ぼす影響を調べます。SimBiology は、グローバル解析、モンテカルロ解析、およびローカルな微分ベースの解析をサポートします。

濃度 - 時間データを表示する、A と B の 2 つの図。図 A は、データを線形スケールで示し、時間ゼロから無限大までの AUC の計算方法を示している。図 B は、同じデータを片対数スケールで示している。

ノンコンパートメント解析

コンパートメント モデルを仮定せずに、薬物濃度の時間経過から PK パラメーターを計算します。単一または複数投与スキームの実験データとシミュレーション データの両方で NCA を実行します。

シミュレーションの高速化

コンパイルした C コードに変換することにより、大規模モデルのシミュレーションまたはモンテ カルロ シミュレーションを高速化します。また、Parallel Computing Toolbox を使用して複数のコア、クラスター、またはクラウドリソースに分散することで、性能をさらに向上させます。

Web アプリとしてモデルを共有

App Designer でアプリを作成後、MATLAB Compiler でパッケージ化し、MATLAB Web App Server を使用してホストします。共同作業者は、ソフトウェアをインストールすることなく、ブラウザーでアプリにアクセスして実行できます。

3 つのコミュニティ共有プロジェクトを並べて表示した、SimBiology Community ホームページ。

コミュニティのツール

MATLAB スクリプトを用いてプログラムで SimBiology を使用し、解析をカスタマイズおよび自動化します。コミュニティが提供するツールを、仮想母集団のシミュレーションなどのモデル解析のアドオンとして使用できます。