コンパイルされた MATLAB 関数を .NET アプリケーションに統合するには、API の組み合わせを使用する必要があります。MATLAB Compiler SDK™ は API を使用して MATLAB Runtime を初期化し、コンパイルされた MATLAB 関数を MATLAB Runtime に読み込み、.NET コードと MATLAB Runtime の間で渡されるデータを管理します。コンパイラは、コンパイルされた関数のシグネチャに基づいて、いくつかの API を生成します。MATLAB Runtime はすべてのアプリケーションで一貫した他の API を提供します。

.NET API は、Web を介してアクティブな Figure を配布し、.NET リモート機能にアクセスするための機能を使用して、分散アプリケーションの開発を容易にします。