oobQuantilePredict

回帰の bag of trees による out-of-bag 観測値の分位数予測

構文

YFit = oobQuantilePredict(Mdl)

YFit = oobQuantilePredict(Mdl,Name,Value)

[YFit,YW] = oobQuantilePredict(___)

説明

YFit = oobQuantilePredict(Mdl) は、回帰の bag of trees である Mdl を使用して、予測子データ Mdl.X 内のすべての out-of-bag 観測値で予測された応答の中央値のベクトルを返します。Mdl は TreeBagger モデルオブジェクトでなければならず、Mdl.OOBIndices を空にすることはできません。

例

YFit = oobQuantilePredict(Mdl,Name,Value) は、1 つ以上の Name,Value 引数のペアによって指定された追加オプションを使用します。たとえば、分位確率や、分位推定に含める木を指定します。

例

[YFit,YW] = oobQuantilePredict(___) は、前の構文のいずれかを使用して、応答の重みのスパース行列も返します。

例

入力引数

すべて展開する

`Mdl` — 回帰の bag of trees
`TreeBagger` モデルオブジェクト (既定値)

回帰の bag of trees。関数 TreeBagger によって作成された TreeBagger モデルオブジェクトとして指定します。

Mdl.Method の値は regression でなければなりません。
関数 TreeBagger を使用して Mdl に学習させる場合、名前と値のペア 'OOBPrediction','on' を指定しなければなりません。このようにすると、必要な out-of-bag 観測値のインデックスの行列が TreeBagger によって Mdl.OOBIndices に格納されます。

名前と値の引数

すべて展開する

オプションの引数のペアを Name1=Value1,...,NameN=ValueN として指定します。ここで Name は引数名、Value は対応する値です。名前と値の引数は他の引数の後に指定しなければなりませんが、ペアの順序は重要ではありません。

R2021a より前では、名前と値をそれぞれコンマを使って区切り、Name を引用符で囲みます。

`Quantile` — 分位確率
`0.5` (既定値) | [0,1] の値が含まれている数値ベクトル

分位確率。'Quantile' と区間 [0,1] の値が含まれている数値ベクトルから構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。oobQuantilePredict は、Mdl.X の各観測値 (行) について、Quantile 内のすべての確率に対応する分位数を推定します。

例: 'Quantile',[0 0.25 0.5 0.75 1]

データ型: single | double

`Trees` — 応答の推定に使用する木のインデックス
`'all'` (既定値) | 正の整数の数値ベクトル

応答の推定に使用する木のインデックス。'Trees' と 'all' または正の整数の数値ベクトルから構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。インデックスは Mdl.Trees のセルに対応します。各セルにはアンサンブル内の木が格納されます。Trees の最大値は、アンサンブル内の木の本数 (Mdl.NumTrees) 以下でなければなりません。

'all' の場合、oobQuantilePredict はインデックスとして 1:Mdl.NumTrees を使用します。

例: 'Trees',[1 10 Mdl.NumTrees]

データ型: char | string | single | double

`TreeWeights` — 各木の応答の重み
非負値の数値ベクトル

各木の応答の重み。'TreeWeights' と numel(trees) 個の非負値による数値ベクトルから構成されるコンマ区切りのペアとして指定します。trees は名前と値のペアの引数 Trees の値です。

既定の設定は、ones(size(trees)) です。

データ型: single | double

出力引数

すべて展開する

`YFit` — 推定された分位数
数値行列

out-of-bag 観測値に対して推定された分位数。n 行 numel(tau) 列の数値行列として返されます。n は学習データ内の観測値の個数 (numel(Mdl.Y))、tau は名前と値のペアの引数 Quantile の値です。つまり YFit(j,k) は、与えられた X(j,:) に対して Mdl を使用して推定した応答分布の 100*tau(k) の百分位数です。

`YW` — 応答の重み
スパース行列

応答の重み。n 行 n 列のスパース行列として返されます。n は学習データ内の応答の個数 (numel(Mdl.Y)) です。YW(:,j) は、Mdl.X(j,:) の観測値について応答の重みを指定します。

oobQuantilePredict は、経験的累積分布関数 (CDF) の線形内挿を使用して分位数を予測します。特定の観測値について、別の方法 (カーネル平滑化を使用した CDF の近似など) によって分位数を推定するために応答の重みを使用できます。

例

すべて展開する

分位点回帰の使用による out-of-bag 中央値の予測

ライブスクリプトを開く

carsmall データセットを読み込みます。与えられたエンジン排気量に対して自動車の燃費 (MPG) を予測するモデルを考えます。

load carsmall

データセット全体を使用して、バギング回帰木のアンサンブルに学習をさせます。100 個の弱学習器を指定し、out-of-bag インデックスを格納します。

rng(1); % For reproducibility
Mdl = TreeBagger(100,Displacement,MPG,'Method','regression',...
    'OOBPrediction','on');

Mdl は TreeBagger アンサンブルです。

分位点回帰を実行して、すべての学習観測値について燃費の out-of-bag 中央値を予測します。

oobMedianMPG = oobQuantilePredict(Mdl);

oobMedianMPG は、並べ替えられた Mdl.X 内の観測値が与えられた場合の応答の条件付き分布に対応する中央値が含まれている n 行 1 列の数値ベクトルです。n は観測値の個数 (size(Mdl.X,1)) です。

観測値を昇順に並べ替えます。同じ Figure に観測値と推定された中央値をプロットします。out-of-bag 中央値および平均応答を比較します。

[sX,idx] = sort(Mdl.X);
oobMeanMPG = oobPredict(Mdl);

figure;
plot(Displacement,MPG,'k.');
hold on
plot(sX,oobMedianMPG(idx));
plot(sX,oobMeanMPG(idx),'r--');
ylabel('Fuel economy');
xlabel('Engine displacement');
legend('Data','Out-of-bag median','Out-of-bag mean');
hold off;

Figure contains an axes object. The axes object with xlabel Engine displacement, ylabel Fuel economy contains 3 objects of type line. One or more of the lines displays its values using only markers These objects represent Data, Out-of-bag median, Out-of-bag mean.

百分位数の使用による out-of-bag 予測区間の推定

ライブスクリプトを開く

carsmall データセットを読み込みます。与えられたエンジン排気量に対して自動車の燃費 (MPG) を予測するモデルを考えます。

load carsmall

データセット全体を使用して、バギング回帰木のアンサンブルに学習をさせます。100 個の弱学習器を指定し、out-of-bag インデックスを格納します。

rng(1); % For reproducibility
Mdl = TreeBagger(100,Displacement,MPG,'Method','regression',...
    'OOBPrediction','on');

分位点回帰を実行して、out-of-bag の 2.5% および 97.5% 百分位数を予測します。

oobQuantPredInts = oobQuantilePredict(Mdl,'Quantile',[0.025,0.975]);

oobQuantPredInts は、Mdl.X 内の out-of-bag 観測値に対応する予測区間が含まれている n 行 2 列の数値行列です。n は観測値の個数 (size(Mdl.X,1)) です。1 列目には 2.5% 百分位数が、2 列目には 97.5% 百分位数が含まれています。

同じ Figure に観測値と推定された中央値をプロットします。MPG の条件付き分布がガウス分布であると仮定して、百分位数の予測区間と 95% の予測区間を比較します。

[oobMeanMPG,oobSTEMeanMPG] = oobPredict(Mdl);
STDNPredInts = oobMeanMPG + [-1 1]*norminv(0.975).*oobSTEMeanMPG;
[sX,idx] = sort(Mdl.X);

figure;
h1 = plot(Displacement,MPG,'k.');
hold on
h2 = plot(sX,oobQuantPredInts(idx,:),'b');
h3 = plot(sX,STDNPredInts(idx,:),'r--');
ylabel('Fuel economy');
xlabel('Engine displacement');
legend([h1,h2(1),h3(1)],{'Data','95% percentile prediction intervals',...
    '95% Gaussian prediction intervals'});
hold off;

Figure contains an axes object. The axes object with xlabel Engine displacement, ylabel Fuel economy contains 5 objects of type line. One or more of the lines displays its values using only markers These objects represent Data, 95% percentile prediction intervals, 95% Gaussian prediction intervals.

分位点回帰の使用による out-of-bag 条件付き累積分布の推定

ライブスクリプトを開く

carsmall データセットを読み込みます。与えられたエンジン排気量に対して自動車の燃費 (MPG) を予測するモデルを考えます。

load carsmall

データセット全体を使用して、バギング回帰木のアンサンブルに学習をさせます。100 個の弱学習器を指定し、out-of-bag インデックスを格納します。

rng(1); % For reproducibility
Mdl = TreeBagger(100,Displacement,MPG,'Method','regression',...
    'OOBPrediction','on');

out-of-bag の応答の重みを推定します。

[~,YW] = oobQuantilePredict(Mdl);

YW は、応答の重みが含まれている n 行 n 列のスパース行列です。n は学習観測値の個数 numel(Y) です。Mdl.X(j,:) の観測値に対する応答の重みは YW(:,j) にあります。応答の重みは、指定された分位確率に依存しません。

以下により、応答の out-of-bag 条件付き累積分布関数 (CCDF) を推定します。

応答を昇順にソートし、さらにそれによって導かれたインデックスを使用して応答の重みをソートします。
並べ替えられた応答の重みの各列に対する累積和を計算します。

[sortY,sortIdx] = sort(Mdl.Y);
cpdf = full(YW(sortIdx,:));
ccdf = cumsum(cpdf);

ccdf(:,j) は、与えられた観測値 j に対する応答の経験的 out-of-bag CCDF です。

4 つの学習観測値の無作為標本を選択します。学習標本をプロットし、選択された観測値を特定します。

[randX,idx] = datasample(Mdl.X,4);
figure;
plot(Mdl.X,Mdl.Y,'o');
hold on
plot(randX,Mdl.Y(idx),'*','MarkerSize',10);
text(randX-10,Mdl.Y(idx)+1.5,{'obs. 1' 'obs. 2' 'obs. 3' 'obs. 4'});
legend('Training Data','Chosen Observations');
xlabel('Engine displacement')
ylabel('Fuel economy')
hold off

Figure contains an axes object. The axes object with xlabel Engine displacement, ylabel Fuel economy contains 6 objects of type line, text. One or more of the lines displays its values using only markers These objects represent Training Data, Chosen Observations.

選択された 4 つの応答の out-of-bag CCDF を同じ Figure にプロットします。

figure;
plot(sortY,ccdf(:,idx));
legend('ccdf given obs. 1','ccdf given obs. 2',...
    'ccdf given obs. 3','ccdf given obs. 4',...
    'Location','SouthEast')
title('Out-of-Bag Conditional Cumulative Distribution Functions')
xlabel('Fuel economy')
ylabel('Empirical CDF')

Figure contains an axes object. The axes object with title Out-of-Bag Conditional Cumulative Distribution Functions, xlabel Fuel economy, ylabel Empirical CDF contains 4 objects of type line. These objects represent ccdf given obs. 1, ccdf given obs. 2, ccdf given obs. 3, ccdf given obs. 4.

詳細

すべて展開する

out-of-bag

バギングアンサンブルにおいて、特定の学習器について学習標本から除外されている観測値は "out-of-bag" です。特定の学習器の学習に使用される場合、観測値は "in-bag" です。

学習器をバギングすると、サイズ n のブートストラップ標本 (つまり、無作為に復元抽出された標本) が各学習器について選択され、対応するブートストラップ標本を使用して学習器の学習が行われます。n 個の観測値から n 個を復元抽出すると、各学習器について平均で約 37% の観測値が除外されます。

out-of-bag アンサンブル誤差は、out-of-bag 観測値のみを使用して推定されるアンサンブル誤差であり、真のアンサンブル誤差の不偏推定量です。

分位点ランダムフォレスト

"分位点ランダムフォレスト" [2] は、与えられた予測子変数の値に対する応答変数の条件付き分布をモデル化するために回帰木のランダムフォレスト [1] を使用する分位点回帰法です。当てはめたモデルを使用して、応答の条件付き分布における分位数を推定できます。

分位推定以外にも、分位点回帰によって予測区間の推定や外れ値の検出ができます。以下に例を示します。

95% 分位の予測区間を推定するため、0.025 および 0.975 分位を推定する。
外れ値を検出するため、0.01 および 0.99 分位を推定する。0.01 の分位数より小さい観測値と 0.99 の分位数より大きい観測値は、すべて外れ値です。区間 [L,U] の外部にある観測値は、すべて外れ値であると考えることができます。

$L = Q_{1} - 1.5 * I Q R$
および

$U = Q_{3} + 1.5 * I Q R,$
ここで
- Q₁ は 0.25 分位です。
- Q₃ は 0.75 分位です。
- IQR = Q₃ - Q₁ ("四分位数間範囲") です。

応答の重み

"応答の重み" は、与えられた予測子空間の値に対する応答の条件付き分布を表すスカラーです。ブートストラップ標本の観測値と学習およびテストの観測値に共有される葉とにより、応答の重みが発生します。

観測値 x が与えられた場合、アンサンブル内の木 t を使用する学習標本内の観測値 j に対する応答の重みは次のようになります。

$w_{t j} (x) = \frac{I {X_{j} \in S_{t} (x)}}{\sum_{k = 1}^{n_{train}} I {X_{k} \in S_{t} (x)}},$

ここで

I{h} はインジケーター関数です。
S_t(x) は、x が含まれている木 t の葉です。
n_train は学習観測値の個数です。

つまり、特定の木の応答の重みは、応答の条件付き相対度数分布を形成します。

アンサンブル全体の応答の重みは、木全体に対する平均です。

$w_{j}^{*} (x) = \frac{1}{T} \sum_{t = 1}^{T} w_{t j} (x) .$

アルゴリズム

oobQuantilePredict は、学習データ (Mdl.X) 内のすべての観測値に quantilePredict を適用することにより out-of-bag 分位数を推定します。各観測値について、その観測値が out-of-bag である木のみが使用されます。

アンサンブル内のすべての木に対して in-bag になっている観測値について、oobQuantilePredict は応答データの標本分位数を割り当てます。つまり、oobQuantilePredict は out-of-bag 観測値には分位点回帰を使用しません。代わりに、quantile(Mdl.Y,tau) を割り当てます。tau は名前と値のペアの引数 Quantile の値です。

参考文献

[1] Meinshausen, N. “Quantile Regression Forests.” Journal of Machine Learning Research, Vol. 7, 2006, pp. 983–999.

[2] Breiman, L. “Random Forests.” Machine Learning. Vol. 45, 2001, pp. 5–32.

バージョン履歴

R2016b で導入

参考

predict | quantilePredict | oobQuantileError | TreeBagger

トピック

カーネル平滑化の使用による条件付き分位の推定

oobQuantilePredict

構文

説明

入力引数

Mdl — 回帰の bag of trees TreeBagger モデル オブジェクト (既定値)

名前と値の引数

Quantile — 分位確率 0.5 (既定値) | [0,1] の値が含まれている数値ベクトル

Trees — 応答の推定に使用する木のインデックス 'all' (既定値) | 正の整数の数値ベクトル

TreeWeights — 各木の応答の重み 非負値の数値ベクトル

出力引数

YFit — 推定された分位数 数値行列

YW — 応答の重み スパース行列

例

分位点回帰の使用による out-of-bag 中央値の予測

百分位数の使用による out-of-bag 予測区間の推定

分位点回帰の使用による out-of-bag 条件付き累積分布の推定

詳細

out-of-bag

分位点ランダム フォレスト

応答の重み

アルゴリズム

参考文献

バージョン履歴

参考

トピック

`Mdl` — 回帰の bag of trees
`TreeBagger` モデルオブジェクト (既定値)

`Quantile` — 分位確率
`0.5` (既定値) | [0,1] の値が含まれている数値ベクトル

`Trees` — 応答の推定に使用する木のインデックス
`'all'` (既定値) | 正の整数の数値ベクトル

`TreeWeights` — 各木の応答の重み
非負値の数値ベクトル

`YFit` — 推定された分位数
数値行列

`YW` — 応答の重み
スパース行列

分位点ランダムフォレスト