MATLAB ジョブスケジューラを統合するための詳細オプションの設定

クラスターと MATLAB^® ジョブスケジューラを統合するときには、以下の手順に従い詳細オプションを設定します。

メモ

MATLAB ジョブスケジューラをはじめて統合する場合、最も一般的な構成オプションについてはMATLAB ジョブスケジューラおよびネットワークライセンスマネージャー向けの MATLAB Parallel Server のインストールと構成を参照してください。

以下の手順において、matlabroot はインストールされている MATLAB Parallel Server™ ソフトウェアの場所を示します。以下の説明でこの文字列が使用されていたら、パスをご使用の場所に置き換えてください。

MATLAB Parallel Server の複数のバージョンの実行

使用している MATLAB ジョブスケジューラのクラスターをアップグレードして、それに接続する MATLAB デスクトップクライアント上で Parallel Computing Toolbox の R2016a 以降のリリースを引き続き使用できます。この下位互換性機能を利用するには、次を行います。

クラスターに MATLAB Parallel Server の最新バージョンをインストールします。クラスターで MATLAB ジョブスケジューラを実行するにはこのバージョンを使用しなければなりません。
クラスター内でサポートする各リリースについて MATLAB Parallel Server をインストールします。たとえば、クラスターと共に R2016a および R2016b を使用するには、MATLAB Parallel Server の R2016a と R2016b の両方のリリースをインストールします。
これらのインストール場所に基づいて MATLAB ジョブスケジューラを構成します。構成ファイル mjs_def の変数 MJS_ADDITIONAL_MATLABROOTS に MATLAB Parallel Server のそれぞれのインストール場所を指定します。このファイルは、matlabroot/toolbox/parallel/bin にあります (Linux の場合は mjs_def.sh、Windows の場合は mjs_def.bat)。詳細については、mjsを参照してください。

この構成により、MATLAB ジョブスケジューラは、インストールされたリリースの MATLAB クライアントにクラスターへのジョブの投入を許可します。MATLAB ジョブスケジューラは動的に適切なバージョンの MATLAB ワーカーを起動してジョブを実行します。

Windows クラスターホストの設定

Windows マシンのクラスター上にはじめて MATLAB Parallel Server をインストールする場合、ジョブが通信できるようにこれらのホストを構成する必要があります。

メモ

Windows クラスターがない場合、または Windows クラスター上に以前のバージョンの MATLAB Parallel Server が既にインストールされている場合は、この手順を省略できます。

クラスターノード上の Windows ファイアウォールの構成

クラスターノード上で Windows^® ファイアウォールを使用している場合は、次を行います。

管理者権限をもつユーザーとしてログインします。
Windows コマンドプロンプトで次を実行します。
```
matlabroot\toolbox\parallel\bin\addMatlabToWindowsFirewall.bat
```
このコマンドは、許可されたプログラムとして MATLAB を追加します。別のファイアウォールを使用している場合は、これと同様の内容になるように構成しなければなりません。

mjs 用の Windows ユーザーアクセスの構成

mjs の実行に使用されるユーザーは、クラスターの MATLAB インストール場所にアクセスできる必要があります。既定で、mjs はユーザー LocalSystem として実行されます。ネットワークが LocalSystem によるインストール場所へのアクセスを許可している場合は、この手順を省略できます (ネットワーク構成および LocalSystem に提供されるアクセスがわからない場合は、MathWorks インストールサポートチームにお問い合わせください)。

メモ

LocalSystem がインストール場所にアクセスできない場合は、mjs を別のユーザーとして実行しなければなりません。

次の手順で別のユーザーを設定できます。

任意の一般的なテキストエディター (ワードパッドなど) を使用して、次の場所にある mjs_def ファイルを開きます。
```
matlabroot\toolbox\parallel\bin\mjs_def.bat
```
MJSUSER パラメーターを設定する行を見つけ、domain\username の形式で値を指定します。
```
set MJSUSER=mydomain\myusername
```
MJSPASS パラメーターを設定することでユーザーのパスワードを指定します。
```
set MJSPASS=password
```
ファイルを保存します。

要求されたサーバー上のポートを開く

mjs サービスでは、BASE_PORT から始めて必要な数だけのポートを使用します。既定では BASE_PORT は 27350 です。

合計 nJ 個のジョブマネージャーと nW 個のワーカーを実行するホストを使用する場合、mjs サービスはそれ自体で使用するために合計 6+2*nJ+4*nW 個の連続するポートを予約します。異なるホスト上にあるものも含め、連携して動作するすべてのジョブマネージャーとワーカーは同一のベースポートを使用しなければなりません。そうしない場合、ジョブマネージャーとワーカーは互いに連絡できなくなります。さらに、MPI 通信は BASE_PORT+1000 から始まるポートで行われ、連続する 2*nW 個のポートを使用します。

たとえば、ジョブマネージャー 1 つとワーカーを 16 個持つホストを使用する場合、次の範囲のポートを開く必要があります。

27350 – 27422: mjs サービス用。
28350 – 28382: MPI 通信用。

既定以外の BASE_PORT を使用して MATLAB からクラスターに接続するには、MATLAB ジョブスケジューラクラスタープロファイルの 'Host' プロパティに BASE_PORT の値を追加しなければなりません。これは、たとえば myMJSHost:44001 のように、Hostname:BASE_PORT の形式で行わなければなりません。

古いインストールの mjs サービスの停止

クラスターノード上で古いバージョンの MATLAB Parallel Server が実行されている場合、新しいインストールのサービスを開始する前に、その mjs サービスを停止する必要があります。

Windows 上の mjs の停止

管理者権限で Windows コマンドウィンドウを開きます。
コマンドウィンドウで、制御スクリプトが含まれている古いインストール環境のフォルダーに移動します。
```
cd oldmatlabroot\toolbox\parallel\bin
```
次のコマンドを入力して、古いサービスを停止しアンインストールして、このサービスに関連付けられているファイルを削除します。
```
mjs uninstall -clean
```
R2019a より前のリリースで、このサービスは mdce と呼ばれています。代わりに、次のコマンドを入力します。
```
cd oldmatlabroot\toolbox\distcomp\bin
mdce uninstall -clean
```
メモ
-clean フラグを使用すると、すべての既存のジョブデータが永久的に削除されます。このデータを削除する前に、今後そのデータを使用することがないことを確認してください。
すべてのワーカーノードでこの手順を繰り返します。

UNIX 上の mjs の停止

root としてログインします root としてログインできない場合は、oldmatlabroot/toolbox/parallel/bin/mjs_def.sh ファイルの CHECKPOINTBASE、LOGBASE、PIDBASE、および該当する場合は LOCKBASE パラメーターを変更し、書き込み権限のあるフォルダーを指すようにしなければなりません。R2019a より前のリリースで、このファイルは oldmatlabroot/toolbox/distcomp/bin/mdce_def.sh です。
それぞれのクラスターノードで、次のコマンドを入力して mjs サービスを停止し、このサービスに関連付けられているファイルを削除します。
```
cd oldmatlabroot/toolbox/parallel/bin
./mjs stop -clean
```
R2019a より前のリリースで、このサービスは mdce と呼ばれています。代わりに、次のコマンドを入力します。
```
cd oldmatlabroot/toolbox/distcomp/bin
./mdce stop -clean
```
メモ
-clean フラグを使用すると、すべての既存のジョブデータが永久的に削除されます。このデータを削除する前に、今後そのデータを使用することがないことを確認してください。

MATLAB ジョブスケジューラのセキュリティレベルの設定

クラスターノードで mjs サービスを開始する前に、セキュリティレベルを設定します。詳細については、セキュリティレベルの設定を参照してください。セキュリティに関する追加の考慮事項については、MATLAB ジョブスケジューラクラスターのセキュリティの設定を参照してください。

`mjs` サービス、MATLAB ジョブスケジューラおよびワーカーの起動 (コマンドライン)

MATLAB ジョブスケジューラは、グラフィカルユーザーインターフェイスまたはコマンドラインを使用して起動できます。グラフィカルユーザーインターフェイスの使用方法については、MATLAB ジョブスケジューラの構成を参照してください。グラフィカルユーザーインターフェイスである管理センターを使用するには、クラスターのすべてのノードに直接ネットワーク接続するコンピューター上で管理センターを実行しなければなりません。そのようなコンピューターで管理センターを実行できない場合は、コマンドラインインターフェイスを使用しなければなりません。コマンドラインインターフェイスの使用方法については、次の手順に従ってください。

コマンドラインインターフェイスの使用 (Windows)

mjs サービスの開始
すべてのノード (ヘッドノードおよびワーカーノード) 上に mjs サービスをインストールしなければなりません。ヘッドノードから始めます。
1. 管理者権限で Windows コマンドウィンドウを開きます。
2. Windows コマンドウィンドウで、制御スクリプトがあるフォルダーに移動します。
```
cd matlabroot\toolbox\parallel\bin
```
3. 次のコマンドを入力して mjs サービスをインストールします。
```
mjs install
```
4. 次のコマンドを入力して mjs サービスを開始します。
```
mjs start
```
5. すべてのワーカーノードでこの手順を繰り返します。
項目 3 ～ 5 の代わりに、1 台のマシンから次のように入力し、リモートで mjs サービスをノードにインストールして開始することもできます。
```
cd matlabroot\toolbox\parallel\bin
ssh hostA mjs install
ssh hostA mjs start
```
hostA は、リモートホストを表します。ssh ユーティリティの詳細については、次のように入力して使用上の注意事項を参照してください。
```
ssh
```
インストールの完了後、mjs サービスはマシンが再起動するたびに実行を開始します。MATLAB ジョブスケジューラやワーカーセッションが実行されているかどうかに関係なく、mjs サービスは明示的な停止またはアンインストールが行われるまで稼働し続けます。
MATLAB ジョブスケジューラの起動
MATLAB ジョブスケジューラを起動するには、Windows コマンドプロンプトで次のコマンドを入力します。MATLAB Parallel Server のインストール環境にアクセスできる場合、MATLAB ジョブスケジューラを実行するマシンで作業する必要はありません。
1. Windows コマンドプロンプトで、スタートアップスクリプトがあるフォルダーに移動します。
```
cd matlabroot\toolbox\parallel\bin
```
2. 名前 <MyMJS> に一意のテキストを指定して MATLAB ジョブスケジューラを起動します。
```
startjobmanager -name <MyMJS> -remotehost <MATLAB Job Scheduler host name> -v
```
3. 目的のホスト上で MATLAB ジョブスケジューラが実行されていることを確認します。
```
nodestatus -remotehost <MATLAB Job Scheduler host name>
```
  メモ
  MATLAB ジョブスケジューラが実行されているホスト上で startjobmanager を実行している場合は、-remotehost フラグを指定する必要はありません。
  クラスター上に複数の MATLAB ジョブスケジューラがある場合、それぞれの名前は一意でなければなりません。
ワーカーの起動
メモ
マシン上でワーカーを起動するには、そのマシン上で既に mjs サービスが実行されていなければなりません。ネットワークライセンスマネージャーを使用している場合は、ネットワーク上で実行されていなければなりません。
ワーカーとして使用するそれぞれのノードに対して、Windows コマンドプロンプトで次のコマンドを入力します。MATLAB Parallel Server のインストール環境にアクセスできる場合、MATLAB ワーカーを実行するマシンで作業する必要はありません。
1. スタートアップスクリプトがあるフォルダーに移動します。
```
cd matlabroot\toolbox\parallel\bin
```
2. このワーカーを登録する MATLAB ジョブスケジューラの名前を表す <MyMJS> について、次のテキストを使用して各ノードでワーカーを起動します。このテキストは 1 行で入力します。
```
startworker -jobmanagerhost <MATLAB Job Scheduler host name>
    -jobmanager <MyMJS> -remotehost <worker host name> -v
```
  同じノード上で複数のワーカーセッションを実行するには、startworker コマンドで -name オプションを使用して各ワーカーに一意の名前を指定し、そのノード上の各ワーカーでそれを実行します。
```
startworker ... -name <worker1 name>
startworker ... -name <worker2 name>
```
3. ワーカーが実行されていることを確認します。
```
nodestatus -remotehost <worker host name>
```
4. すべてのワーカーノードについて項目 b ～ c を繰り返します。
mjs、MATLAB ジョブスケジューラおよびワーカープロセスの詳細 (シャットダウンおよびカスタマイズの方法) については、MATLAB ジョブスケジューラクラスターのカスタマイズを参照してください。

コマンドラインインターフェイスの使用 (UNIX)

mjs サービスの開始
各クラスターノードで、次のコマンドを入力して mjs サービスを開始します。
```
cd matlabroot/toolbox/parallel/bin
./mjs start
```
また、1 台のマシンから次のように入力して、ノードで mjs サービスをリモートで起動することもできます。
```
cd matlabroot/toolbox/parallel/bin
ssh hostA matlabroot/toolbox/parallel/bin/mjs start
ssh hostB matlabroot/toolbox/parallel/bin/mjs start
ssh hostC matlabroot/toolbox/parallel/bin/mjs start
```
hostA、hostB、および hostC は、リモートホスト名を表します。ホスト名のリストが長い場合は、1 台のマシンから次のように入力して、複数のノードで mjs サービスをリモートで起動することもできます。
```
for host in hostA hostB hostC;
 do ssh $host matlabroot/toolbox/parallel/bin/mjs start;
done 
```
ssh ユーティリティの詳細については、次のように入力して使用上の注意事項を参照してください。
```
ssh
```
また、次のように入力してシステムリファレンスマニュアルにアクセスすることもできます。
```
man ssh
```
MATLAB ジョブスケジューラの起動
MATLAB ジョブスケジューラを起動するには、次のコマンドを入力します。MATLAB Parallel Server のインストール環境にアクセスできる場合、MATLAB ジョブスケジューラを実行するマシンで作業する必要はありません。
1. スタートアップスクリプトがあるフォルダーに移動します。
```
cd matlabroot/toolbox/parallel/bin
```
2. 名前 <MyMJS> に一意のテキストを指定して MATLAB ジョブスケジューラを起動します。このテキストは 1 行で入力します。
```
./startjobmanager -name <MyMJS> -remotehost <MATLAB Job Scheduler host name> -v
```
3. MATLAB ジョブスケジューラが目的のホスト上で実行されていることを確認します。
```
./nodestatus -remotehost <MATLAB Job Scheduler host name>
```
  メモ
  クラスター上に複数の MATLAB ジョブスケジューラがある場合、それぞれの名前は一意でなければなりません。
ワーカーの起動
メモ
マシン上でワーカーを起動するには、そのマシン上で既に mjs サービスが実行されていなければなりません。ネットワークライセンスマネージャーを使用している場合は、ネットワーク上で実行されていなければなりません。
MATLAB ワーカーをホスティングするコンピューターごとに、次のコマンドを入力します。MATLAB Parallel Server のインストール環境にアクセスできる場合、MATLAB ワーカーを実行するマシンで作業する必要はありません。
1. スタートアップスクリプトがあるフォルダーに移動します。
```
cd matlabroot/toolbox/parallel/bin
```
2. このワーカーを登録する MATLAB ジョブスケジューラの名前を表す <MyMJS> について、次のテキストを使用して各ノードでワーカーを起動します。このテキストは 1 行で入力します。
```
./startworker -jobmanagerhost <MATLAB Job Scheduler host name>
   -jobmanager <MyMJS> -remotehost <worker host name> -v
```
  同じマシンで複数のワーカーセッションを実行するには、-name オプションを使用して各ワーカーに一意の名前を指定します。
```
./startworker ... -name <worker1>
./startworker ... -name <worker2>
```
3. ワーカーが実行されていることを確認します。ワーカーノードごとに次のコマンドを実行します。
```
./nodestatus -remotehost <worker host name>
```
mjs、MATLAB ジョブスケジューラおよびワーカープロセスの詳細 (シャットダウンおよびカスタマイズの方法) については、MATLAB ジョブスケジューラクラスターのカスタマイズを参照してください。

マシンの起動時に自動開始する mjs サービスのインストール (UNIX)

この手順は必須ではありませんが、システムクラッシュの際に役立ちます。これを設定すると、マシンが再起動するたびに、mjs サービスの実行が開始されます。MATLAB ジョブスケジューラまたはワーカーのセッションが実行されているかどうかに関係なく、mjs サービスは明示的に停止されるまで稼働し続けます。

この手順を実行するには、ルート権限が必要です。

Debian、Fedora、SUSE および Red Hat (非 Fedora) のプラットフォーム

クラスターノードごとに以下の手順に従って mjs サービスを既知のサービスとして登録し、システムの起動時に自動的に開始されるように設定します。

次のリンクを、もしまだ無ければ作成します。
```
ln -s matlabroot/toolbox/parallel/bin/mjs /etc/mjs
```
起動スクリプトファイルへの次のリンクを作成します。
```
ln -s matlabroot/toolbox/parallel/bin/mjs /etc/init.d/mjs
```
起動スクリプトファイルのアクセス許可を設定します。
```
chmod 555 /etc/init.d/mjs
```
既定の実行レベルを調べます。SysV Linux^® マシンがある場合、マシンを起動してからただちに $runlevel コマンドを実行することで、既定の実行レベルを判定できます。2 番目の数字の出力が、システムの既定の実行レベルです。使用している Linux マシンが SysV をサポートしていない場合は、/etc/inittab 内で既定の実行レベルを探します。
実行レベルを判定したら、その実行レベルに関連付けられている rc フォルダー内にリンクを作成します。たとえば、実行レベルが 5 の場合、以下のプラットフォーム固有のコマンドセットのいずれかを実行します。
- Debian および Fedora プラットフォーム:
```
cd /etc/rc5.d;
ln -s ../init.d/mjs S99MJS
```
- SUSE プラットフォーム:
```
cd /etc/init.d/rc5.d;
ln -s ../mjs S99MJS
```
- Red Hat プラットフォーム (非 Fedora):
```
cd /etc/rc.d/rc5.d;
ln -s ../../init.d/mjs S99MJS
```

MATLAB ジョブスケジューラを含むインストール環境の検証

MATLAB Parallel Server 製品のインストールおよび構成が正しく行われたことを確認するには、クラスタープロファイルを作成して検証します。詳細については、MATLAB Parallel Server クラスターへの MATLAB クライアントの接続を参照してください。プロファイルの検証時にクラスター全体を占有しないように、使用するワーカー数を指定できます。検証をパスしなかった場合は、MathWorks インストールサポートチームに問い合わせるか、一般的な問題のトラブルシューティングを参照してください。

クラスタープロファイルの作成後に、アプリケーションに適した任意の変更を加えることができます (NumWorkersRange、AttachedFiles、AdditionalPaths など)。他のユーザー用にプロファイルを保存するには、クラスタープロファイルマネージャーでプロファイルを選択し、[エクスポート] をクリックしてから、便利な場所のファイルにプロファイルを保存します。後で、クラスタープロファイルマネージャーの実行中に、他のユーザーは [インポート] をクリックしてこのプロファイルをインポートできます。クラスタープロファイルの詳細については、クラスターの検出とクラスタープロファイルの使用 (Parallel Computing Toolbox)を参照してください。