化学

MATLAB は、分子探索と計算化学に対応した堅牢な環境を提供します。ケモインフォマティクス、人工知能 (AI)、量子化学の先進的なツールを使用して、化学構造やデータセットをインポート、可視化、解析できます。Python® の相互運用性により、RDKit、Psi4、VASP、LAMMPS などのライブラリを統合して、創薬設計、物性予測、分子シミュレーション、電子構造解析のワークフロー全体を構築できます。

MATLAB と Simulink を使用すると、以下を行うことができます。

  • 大規模な分子データセット (SDF、SMILES、CSV など) のインポート、可視化、分割
  • MATLAB と RDKit のワークフローを用いて、分子フィンガープリントを計算し、類似性解析を実行
  • GPU による高速化を活用し、大規模なクラスタリングと類似性計算を実行
  • サードパーティ製のツールを使用して、量子化学計算 (DFT、分子動力学、電子物性) を統合
  • ワークフローを自動化し、ケモインフォマティクス、AI、計算化学を組み合わせて、研究に活用
  • 再現可能なスクリプトと対話型のアプリを共有し、コラボレーションや教育に活用
ケモインフォマティクス、構造物性相関、計算化学に関連する主要なツールや手法の用語を含むワードクラウド。

MATLAB と RDKit を用いたケモインフォマティクス

MATLAB を RDKit と組み合わせて使用し、分子データセットを MATLAB でインポート、可視化、分割することで、ケモインフォマティクスのワークフローを効率化できます。

正規化された LogP 値と LogS 値に基づいて分割したデータ散布図。
ヘリウムの動径電子密度。M-SPARC 法と KSSOLVE 法を比較し、エネルギー値をラベル表示している。

密度汎関数理論

MATLAB を使用して、密度汎関数理論 (DFT) の授業を支援します。すぐに使えるツールを利用して、デモ、量子計算、対話形式の可視化が可能です。

MATLAB と Psi4 の分子動力学シミュレーション ワークフロー

MATLAB 内で Psi4 を用いて分子動力学と量子化学のシミュレーションを実行し、計算化学ワークフローを容易に検討できます。

SiO2 の結晶構造。

MATLAB 用の VASPLAB

MATLAB 用の VASPLAB (コミュニティ ツールキット) を使用して、計算化学向けの VASP シミュレーション結果を解析および可視化します。

全身の生理学的薬物動態 (PBPK) モデル

SimBiology を使用して、全身 PBPK のモデル化とシミュレーションを行います。

主要臓器および組織における薬物分布を示す全身の PBPK モデル図。

製品

分子探索の用途に使用される製品をご紹介します。