MATLAB は、分子探索と計算化学に対応した堅牢な環境を提供します。ケモインフォマティクス、人工知能 (AI)、量子化学の先進的なツールを使用して、化学構造やデータセットをインポート、可視化、解析できます。Python® の相互運用性により、RDKit、Psi4、VASP、LAMMPS などのライブラリを統合して、創薬設計、物性予測、分子シミュレーション、電子構造解析のワークフロー全体を構築できます。
MATLAB と Simulink を使用すると、以下を行うことができます。
- 大規模な分子データセット (SDF、SMILES、CSV など) のインポート、可視化、分割
- MATLAB と RDKit のワークフローを用いて、分子フィンガープリントを計算し、類似性解析を実行
- GPU による高速化を活用し、大規模なクラスタリングと類似性計算を実行
- サードパーティ製のツールを使用して、量子化学計算 (DFT、分子動力学、電子物性) を統合
- ワークフローを自動化し、ケモインフォマティクス、AI、計算化学を組み合わせて、研究に活用
- 再現可能なスクリプトと対話型のアプリを共有し、コラボレーションや教育に活用
MATLAB と RDKit を用いたケモインフォマティクス
MATLAB を RDKit と組み合わせて使用し、分子データセットを MATLAB でインポート、可視化、分割することで、ケモインフォマティクスのワークフローを効率化できます。
密度汎関数理論
MATLAB を使用して、密度汎関数理論 (DFT) の授業を支援します。すぐに使えるツールを利用して、デモ、量子計算、対話形式の可視化が可能です。
MATLAB と Psi4 の分子動力学シミュレーション ワークフロー
MATLAB 内で Psi4 を用いて分子動力学と量子化学のシミュレーションを実行し、計算化学ワークフローを容易に検討できます。
MATLAB 用の VASPLAB
MATLAB 用の VASPLAB (コミュニティ ツールキット) を使用して、計算化学向けの VASP シミュレーション結果を解析および可視化します。
全身の生理学的薬物動態 (PBPK) モデル
SimBiology を使用して、全身 PBPK のモデル化とシミュレーションを行います。