たとえばデータ型をdoubleからsingleに変えればデータサイズは半分になりますので、8GBは切ります。ですが、結局mesh関数に入れた後内部でいろんな中間生成配列ができますので、8GBは超えてしまうかと思います。int8型まで圧縮できれば、というところですが、スケーリングすることになるので元の値が変わってしまいます。
ですので、43481x43481のままですと厳しいかと思います。間引いてサイズを減らすか、分割するというのがスタンダードな作戦かと思います。
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