2ch 出力する場合は、 y を M行2列の行列で定義します。
現状の wavedata1, wavedata2 は行ベクトルのようですので、
>> wavedata = [wavedata1', wavedata2'];
のように各行ベクトルを転置して、横方向に列ベクトルを結合することで 96001x2 の行列を作成することができます。
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