How can I save the values of all image in excel each time?

I calculate statistical from VT image and segmented image.So I use a loop to go through all image (100 image) from two folders and calculate the values..How can I save the values of all image in excel in different columns each time?

Answer 1

[Walter Roberson]

Easiest way is to store them in different columns of an array (possibly a cell array) as you go, and xlswrite once at the end.

[dziri halima]

    if true
      addpath('ROI');

   addpath('VT');
  folder = dir('ROI');
  folder2 = dir('VT');
  len = length(folder);
  len2 = length(folder2);

for k = 3:len

      Im1 = folder(k).name;

      Ivg = imread(Im1);

      pause(0.25);

      imshow(Ivg);

      title(['Image' , num2str(k-2)]);

      pause(0.25);

     Im2 = folder(k).name;

    roi_Maskfinal= imread(Im2);

      pause(0.25);

      imshow(  roi_Maskfinal);

      title(['reference' , num2str(k-2)]);

invroiMask= not(roi_Maskfinal);
invbwfinal= not(Ivg);
% figure,imshow(invroiMask), title('InvroiMask','Color','r');
% figure,imshow(invbwfinal), title('Invbwfinal','Color','r');

%//////// Nombre du Pixels non VG (inverse VT)//////// %

nbPixelinvroiMask=sum(invroiMask(:));

%////////      Nombre du Pixels VG (VT)      //////// %

   nbPixelroiMask=sum(roi_Maskfinal(:));

   %//////// Nombre du Pixels Segmentés (Automatique)//////// %

   nbPixelbwfinal=sum(Ivg(:));

   %////////            Nombre du Pixesl commun      //////// %

   Im_commun=roi_Maskfinal&Ivg;
  %  figure,imshow( Im_commun), title('Image Commun','Color','b');
  %  imwrite(invbwfinal,strcat(SaveDir,'Image Commun\','CD_',num2str(26),'-+-',time,'-+-','.tif'));
   nbPixelIm_commun=sum(Im_commun(:));

   Im_union=roi_Maskfinal|Ivg;
  %  figure,imshow(Im_union), title('Image Union','Color','b');
  %  imwrite(invbwfinal,strcat(SaveDir,'Image Union\','CD_',num2str(26),'-+-',time,'-+-','.tif'));
   nbPixelIm_union=sum(Im_union(:));

   %return

%//////// Vrai-Positf : Le pixel est détecté dans la segmentation automatique et dans la segmentation manuelle(VT)

Im_vrai_positif=Ivg&roi_Maskfinal;
% figure,imshow(Im_vrai_positif), title('Image Vrai Positif','Color','r');
% imwrite(Im_vrai_positif,strcat(SaveDir,'Image Vrai Positif\','CD_',num2str(26),'-+-',time,'-+-','.tif'));
nbPixel_vrai_positif=sum(Im_vrai_positif(:));

%//////// Vrai-Negatif : Le pixel n'est pas détecté dans la segmentation automatique et dans la segmentation manuelle(VT)

Im_vrai_negatif = invbwfinal&invroiMask;
% figure,imshow(Im_vrai_negatif), title('Image Vrai Negatif','Color','r');
% imwrite(Im_vrai_negatif,strcat(SaveDir,'Image Vrai Negatif\','CD_',num2str(26),'-+-',time,'-+-','.tif'));
nbPixel_vrai_negatif=sum(Im_vrai_negatif(:));

%//////// Faux-Positif : Le pixel est deteceté dans la segmentation automatique mais n'est pas détecté dans la segmentation manuelle(VT)

Im_faux_positif = Ivg&invroiMask;
% figure,imshow(Im_faux_positif), title('Image Faux Positif','Color','r');
% imwrite(Im_faux_positif,strcat(SaveDir,'Image Faux Positif\','CD_',num2str(26),'-+-',time,'-+-','.tif'));
nbPixel_faux_positif=sum(Im_faux_positif(:));

%//////// Faux-Negatif : Le pixel n'est pas deteceté dans la segmentation automatique mais détecté dans la segmentation manuelle(VT)

Im_faux_negatif = invbwfinal&roi_Maskfinal;
% figure,imshow(Im_faux_negatif), title('Image Faux Negatif','Color','r');
nbPixel_faux_negatif=sum(Im_faux_negatif(:));

%//////// sensibilty (SE)

    SE= (nbPixel_vrai_positif/(nbPixel_vrai_positif+nbPixel_faux_negatif))*100;

    %////////  specifity (SP)

    SP= (nbPixel_vrai_negatif/(nbPixel_faux_positif+nbPixel_vrai_negatif))*100;

    %//////// Accuracy (AC)

     AC= ((nbPixel_vrai_positif+nbPixel_vrai_negatif)/(nbPixel_vrai_positif+nbPixel_faux_negatif+nbPixel_vrai_negatif+nbPixel_faux_positif))*100;

     %//////// La présicion (PR)

     PR=(nbPixel_vrai_positif/(nbPixel_vrai_positif+nbPixel_faux_positif));

    %//////// Recall(RC)

     RC=nbPixel_vrai_positif/(nbPixel_vrai_positif+nbPixel_faux_negatif);

     %//////// F_measure

     F_measure =2*((PR*RC)/(PR+RC));

    %//////// La sur-detection 

    C_surdetection = (nbPixel_faux_positif/ nbPixelinvroiMask)*100;

    %//////// La sous-detection 

    C_sousdetection = (nbPixel_faux_negatif/ nbPixelroiMask)*100;

    %//////// Indice de Jaccard

    I_Jaccard=nbPixelIm_commun/nbPixelIm_union;

    %//////// Indice de Dice

   I_Dice=(2*nbPixelIm_commun)/(nbPixelroiMask+nbPixelbwfinal);

%-+-+-+-+-+-+-+-+- Results-+-+-+-+-+-+-+-+-%

Results= [nbPixel_vrai_positif,nbPixel_vrai_negatif,nbPixel_faux_positif,nbPixel_faux_negatif,SE, SP, AC,PR, RC, F_measure,C_surdetection,C_sousdetection,I_Jaccard,I_Dice,nbPixelinvroiMask ]

filename = 'evaluation2.xlsx';
 xlRange = 'A1';
sheet = 2;
xlswrite(filename,Results,sheet,  xlRange)  
   end
  end

this is my code it run but it save the laster results in sheet2 for 100 image .

[Walter Roberson]

Change

Results= [nbPixel_vrai_positif,nbPixel_vrai_negatif,nbPixel_faux_positif,nbPixel_faux_negatif,SE, SP, AC,PR, RC, F_measure,C_surdetection,C_sousdetection,I_Jaccard,I_Dice,nbPixelinvroiMask ]

to

Results(k-2, :) = [nbPixel_vrai_positif,nbPixel_vrai_negatif,nbPixel_faux_positif,nbPixel_faux_negatif,SE, SP, AC,PR, RC, F_measure,C_surdetection,C_sousdetection,I_Jaccard,I_Dice,nbPixelinvroiMask ];

And move the lines

filename = 'evaluation2.xlsx';
 xlRange = 'A1';
sheet = 2;
xlswrite(filename,Results,sheet,  xlRange)

to after the last "for" loop.

[dziri halima]

thank's sur ,i change my code, but it has error.

Subscripted assignment dimension mismatch.

Error in boucle (line 154)
Results (k-2, :)= [nbPixel_vrai_positif,nbPixel_vrai_negatif,nbPixel_faux_positif,nbPixel_faux_negatif,SE, SP, AC,PR, RC,
F_measure,C_surdetection,C_sousdetection,I_Jaccard,I_Dice,nbPixelinvroiMask ]

[Image Analyst]

What does this show (put it before that line):

whos  Results
tempVar = [nbPixel_vrai_positif,nbPixel_vrai_negatif,nbPixel_faux_positif,nbPixel_faux_negatif,SE, SP, AC,PR, RC,F_measure,C_surdetection,C_sousdetection,I_Jaccard,I_Dice,nbPixelinvroiMask ]
whos tempVar

The number of columns in each must be the same, and the tempVar must have only one row.

[dziri halima]

Thank's sur,i use it but it save all result in the same row .I would save for each run result in individual row . xlrange='A1:O1' for first result xlrange='A2:O2' for second........ I try to write this code but it not work xlrange='A(k):O(K)'