same matrix but not equal problem

I have two matrix: C and C1, they are totally the same, but when I used

isequal(C,C1)

Matlab returns 0.

could anyone help me figure why this happens?

Best! Yu

Answer 1

[John D'Errico]

When you see something that you do not understand, LOOK AT YOUR DATA.

C(1,:)
ans =
  Columns 1 through 31
   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN
  Columns 32 through 45
   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN

C1(1,:)
ans =
  Columns 1 through 31
   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN
  Columns 32 through 45
   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN   NaN

isequal(NaN,NaN)
ans =
  logical
   0

NaN == NaN
ans =
  logical
   0

NaNs are not equal to NaNs.

nnz(isnan(C))
ans =
      543150

numel(C)
ans =
      995220

Roughly half of your array elements are NaN.

You can test for equality, where NaNs are considered to be equal to NaNs, using isequaln.

isequaln(C,C1)
ans =
  logical
   1

Answer 2

[Walter Roberson]

The matrices contain NaN. It is a property of NaN that NaN ~= NaN

>> isequaln(C,C1)
ans =
  logical
   1

(requires R2012a or later)