信号のハンドルを取得し、'signalPropagation' プロパティを'on'に設定することで実現できます。
変更を行う信号があるモデルを開いた状態で、下記のコマンドを実行します。
sys = get_param(bdroot, 'Handle');
l = find_system(sys, 'FindAll', 'on', 'type', 'line')
for i=1:length(l)
%set(l(i),'signalPropagation','off'); % OFF にする場合
set(l(i),'signalPropagation','on') % ON にする場合
end