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並列計算を使用する交差検証の実装

簡単な並列交差検証

この例では、関数 crossval のリファレンス ページにある最初の例を並列実行します。

mypool = parpool()
Starting parpool using the 'local' profile ... connected to 2 workers.

mypool = 

  Pool with properties:

    AttachedFiles: {0x1 cell}
       NumWorkers: 2
      IdleTimeout: 30
          Cluster: [1x1 parallel.cluster.Local]
     RequestQueue: [1x1 parallel.RequestQueue]
      SpmdEnabled: 1opts = statset('UseParallel',true);

load('fisheriris');
y = meas(:,1);
X = [ones(size(y,1),1),meas(:,2:4)];
regf=@(XTRAIN,ytrain,XTEST)(XTEST*regress(ytrain,XTRAIN));

cvMse = crossval('mse',X,y,'Predfun',regf,'Options',opts)

cvMse =

    0.1028

この簡単な例は並列計算の候補としては適切ではありません。

% How long to compute in serial?
tic;cvMse = crossval('mse',X,y,'Predfun',regf);toc
Elapsed time is 0.073438 seconds.

% How long to compute in parallel?
tic;cvMse = crossval('mse',X,y,'Predfun',regf,...
    'Options',opts);toc
Elapsed time is 0.289585 seconds.

再現性のある並列交差検証

crossval を再現性があるように並列実行するには、オプションを適切に設定し、乱数ストリームを適切にリセットします (再現性のある並列計算を実行するを参照)。

mypool = parpool()

Starting parpool using the 'local' profile ... connected to 2 workers.

mypool = 

  Pool with properties:

    AttachedFiles: {0x1 cell}
       NumWorkers: 2
      IdleTimeout: 30
          Cluster: [1x1 parallel.cluster.Local]
     RequestQueue: [1x1 parallel.RequestQueue]
      SpmdEnabled: 1

s = RandStream('mlfg6331_64');
opts = statset('UseParallel',true,...
    'Streams',s,'UseSubstreams',true);

load('fisheriris');
y = meas(:,1);
X = [ones(size(y,1),1),meas(:,2:4)];
regf=@(XTRAIN,ytrain,XTEST)(XTEST*regress(ytrain,XTRAIN));

cvMse = crossval('mse',X,y,'Predfun',regf,'Options',opts)

cvMse =

    0.1020

ストリームをリセットします。

reset(s)
cvMse = crossval('mse',X,y,'Predfun',regf,'Options',opts)

cvMse =

    0.1020