iddoweiner/Coding-Sequence-optimization-for-Chlamydomonas-reinhardtii

バージョン 2.0.0.0 (3.4 MB) 作成者: Iddo Weiner
Coding Sequence optimization for Chlamydomonas reinhardtii
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(0)
ダウンロード: 89
更新 2018/3/30
GitHub でライセンスを表示

This program provides an implementation for carrying out the sequence optimization described in:
'Enhancing Heterologous Expression in C. reinhardtii by Transcript Sequence Optimization'
Weiner et al., The Plant Journal, 2018
This is a standalone application for optimizing DNA sequences meant for achieving high expression in Chlamydomonas reinhardtii (the MATLAB source code is available too).
The fascinating Chlamydomonas picture used as this app's logo was taken by Gerd Guenther:
(https://www.allposters.com/-st/Gerd-Guenther-Posters_c180530_.htm)

引用

Iddo Weiner (2024). iddoweiner/Coding-Sequence-optimization-for-Chlamydomonas-reinhardtii (https://github.com/iddoweiner/Coding-Sequence-optimization-for-Chlamydomonas-reinhardtii), GitHub. 取得済み .

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作成: R2015a
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バージョン 公開済み リリース ノート
2.0.0.0

We improved the GUI
I added an .exe file for installing a GUI that conveniently runs our optimization algorithm "behind the scenes" and returns the optimized sequence.
This file is located in the linked Github repository.
highlighted the availability of the source code
Find both source code and a GUI to run it in the linked Github repository
We also added the MATLAB source code for the convenience of MATLAB users
1.0.0.0

この GitHub アドオンでの問題を表示または報告するには、GitHub リポジトリにアクセスしてください。
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